赵秉钧作为国务总理兼内务总长，在本应属于其职责范围的收抚共进会一事上，并非主导人物。他发给江苏驻沪巡查长应夔丞应密电本，以及指示洪述祖一手经理应夔丞领取津贴事，纯属公事公办，毫无阴谋之可言。赵对袁派洪、应秘密南下调查欢迎国会团原本全然不知，只因应夔丞致电函于国务院，报告调查情况，并请赵转陈总统，致使赵被牵入局中。赵通过应夔丞所来东冬二电，知晓洪、应二人欲以非法手段操弄宪法起草，也看到了二人欲借机构陷孙黄宋的计划，但他并未阻止，而是将冬电交给了洪，洪又面呈袁。当洪谎称收到应夔丞密电，向赵借阅应密电本时，赵顺势将应密电本交给洪，从而退出了构陷阴谋。此后，洪、应二人以信件和应密电往来，谋划杀宋，以及试图以低价购买公债谋取利益，赵已全然不知。案发后，舆论攻击赵为刺宋幕后主使，赵屡次提出辞职，要求赴沪与凶手对质，均为袁所拒绝。宋案证据宣布后，赵在总统府主导之下发表勘电，力辩自己及政府与刺宋案无关。但当上海地方检察厅两次发来传票时，赵又在袁支持下两次拒绝出庭对质，以牺牲个人声誉为代价，维护了袁的利益。
    洪述祖是内务部秘书，应夔丞是共进会会长及江苏驻沪巡查长，二人为获取私利，在宋案各环节既相互配合，又相互欺骗，各怀鬼胎。二人先是借袁世凯欲收抚共进会之机建立起诡秘关系，合谋骗得遣散费5万元。接着又利用袁世凯欲解散欢迎国会团，派二人秘密调查该团真相之机，提出操弄宪法起草及构陷孙黄宋计划，试图乘机再索一笔巨款。但洪没料到，应不但欺骗了中央，也欺骗了他，购买所谓宋犯骗案刑事提票始终无果，构陷阴谋宣告失败。但洪并没有收手，反而唆使应夔丞以暴力对宋乘机下手。应则利欲熏心，乘机提出以六六二折的低价购买公债，变相取利，以为杀宋回报。洪为获取私利，一方面接受应夔丞提出的要求，试图向财政部兜揽；另一方面又恐折扣大，通不过，遂假托中央名义，抛出燬宋酬勋位诱饵，以为替代方案。但应对勋位虚名并无兴趣，于是，洪再次假托中央名义，谎称债票特别准，促应杀宋。案发后，应、武均被抓获，洪则被袁故纵至青岛德国租界。
    程经世作为国务总理赵秉钧之秘书，因最初负责译呈应密电报而知悉洪、应等操弄宪法起草及构陷孙黄宋之阴谋，但因赵秉钧后来将应密电本借给了洪，洪、应后来所谋划之事，程经世一概不知。洪述祖逃至青岛后，程经世曾与言敦源南下见洪，表面为劝其归案，实则代表政府与洪进行幕后交易。上海地方检察厅向其发出传票后，程又以自己仅为秘书，奉命办事，以及生病为由，拒绝出庭。至于朱荫榛，为应夔丞手下差遣员，他在宋教仁被刺当晚奉应夔丞之命启程赴京领取驻沪巡查长津贴，其事属实，但他同时又不自觉地充当了应夔丞写给洪述祖最后一封信的信使，可惜该信今已不可得见。
    需要强调指出的是，袁世凯虽然不曾指使洪、应杀宋，赵秉钧虽然对杀宋计划毫不知情，但这并不意味着二人对惨案的发生完全没有责任，毕竟洪、应均为政府所用之人，洪且为袁之私人。诚如论者所云：洪述祖一前清北洋候补道员也，应夔丞一前清漏网之江湖大盗也政府之用应、洪，举措乖方，虽百口不能辨其无罪。[88]又有论者谓，应之无赖，程、朱二督皆曾密报，洪之历史，庄思缄亦尝警告，谓不可用，袁世凯为了解散共进会及对付国民党竟用之，至为洪、应欺骗，乃至酿成杀宋惨案，方叹小人不可与作缘。[89]故《民立报》批评道：直接以杀宋者洪、应，而间接以杀宋者，乃夫己氏也。非豢蛇者，则虺蝮何从恣其虐；非夫己氏，则洪、应曷从肆其毒。即使并不知情，而任用匪人、教猱升木之罪，已不可少逭矣。[90]
    赵秉钧所负责的内务部被时人视为民国第一旧窟，其间以旧官僚为最多，分子最杂，[91]洪述祖即为其应唐绍仪之请而安插的旧官僚。《新闻报》批评道：洪述祖如此小人，不应引用，惟小人而后用小人，国事一遭至此，赵实不胜总理之任。[92]《大自由报》也有一段内容虽不尽符合实情，却不失精彩的议论，批评赵秉钧碍于私人情面任用洪述祖，结果反受其害。其言道：
    洪述祖为唐绍仪之私人，应夔丞为陈其美之党徒，此等流氓小人，稍知自爱者皆当羞与为伍。古人云：交浅而言深，达者不为也。内务部秘书与内务总长之关系，赵秉钧岂不知之，伏盗贼于肘下，引虎狼于卧闼，何昧昧若是耶！噫，吾知之矣。赵秉钧决非昏昏者，彼盖内顾唐绍仪之情面，外撄孙、黄之势焰，吞声忍气，不能超然个人的私谊之范围外，以尽吾责任之天职，常欲挟一使贪使诈之心，卒之为贪诈所役使、所中伤。凡此，皆误于赵秉钧之圆滑二字。不但此也，身居国家最高机关，牵一发而全身动，身败名裂，全国为之震撼，赵秉钧果何所辞其咎哉！[93]